種子是農業的“芯片”，是確保國家糧食安全和農業高質量發展的“源頭”。推進種業振興，是牢牢把住糧食安全主動權的關鍵。東亞種業在過去的發展路程及未來的規劃中，始終將研發育種、科技創新當作企業命脈，抓緊培育具有自主知識產權的優良品種，持續加大科研投入，擁有目前中國農業領域最先進的實驗室之一的“玉米生物育種國家重點實驗室”及“東北主要作物遺傳育種重點實驗室”。東亞種業自2006年參與國家火炬計劃至今，承擔了國家各級政府部門的系列科研任務百余項，包括多個國家轉基因重大專項和技術攻關；入選首批“國家農作物品種展示評價基地”；是遼寧省唯一一家被列入“國家種業補短板陣型”的企業，全國玉米領域僅14家。目前，公司累計在全國共審定了玉米品種1214個（次），含國審品種90個，每年有近10-20項科研成果推廣應用，公司玉米品種累計審定數量位居行業前列。

遼寧東亞現代種業研發中心是在遼寧省政府和科技廳支持下，于 2013 年投建，2016 年底正式投入使用的大型種業公共研發實驗室、省部級重點實驗室。總部位于遼寧省沈陽市農業高新技術園區，占地 65 畝，實驗室面積 12000平，配套建設 1000平現代智能溫室及各類溫室大棚、冷棚等設施。中心引進（含自主研發或聯合自主開發）各類分子檢測、種子切片及品種分析設備 400 余臺（套），為國內外理論研究、育種研發及品種推廣、市場經營提供技術支撐。中心以分子育種技術研發和基因編輯、組織培養為基礎，向應用方向延伸，目前具備高通量DNA 提取、高通量前景標記檢測、高通量背景標記檢測、高通量品種檢測（含品種真實性、純度、轉基因及其他指標檢測）以及高通量組織培養等能力。
2022年9月29日，遼寧東亞種業有限公司參與的由北京市農林科學院、全國農業技術推廣服務中心等8家單位共同完成的《玉米品種分子檢測技術研發創新于應用推廣》項目，獲得了2019-2021年度全國農牧漁業豐收獎一等獎，本屆豐收獎評出成果獎81項、二三等獎各160項、貢獻獎500人、合作獎20項。

遼寧東亞現代種業研發中心作為遼寧省種業產業共性研發平臺，秉承合作共贏理念，尋求平臺共享合作模式，積極為種業理論、種業科技、種業企業、種業產業服務，截至目前，共為19省的60余家種業公司、高校、科研院所提供檢測服務共完成檢測項目2000多次，樣品數量140余萬份，包括SNP檢測、SSR檢測、DNA提取、芯片服務、種子真實性和純度鑒定、轉基因檢測等。除此之外，研發中心還參與本省大豆品種審定的DNA指紋庫構建，建立了征集樣品、審定品種、商業品種的DNA指紋庫，并為委托方提供建庫服務，入指紋庫的樣品數近萬份，涵蓋玉米、水稻、大豆、高粱、白菜、番茄、生菜、花生、蕓薹等多種作物。同時加入了遼寧省農業標準化技術委員會種子分委會，參與DNA檢測技術地方標準的研發，為豐富和完善適合本區域作物和品種的檢測技術開發貢獻力量。

1. 助力理論基礎研究
借助研發中心 Douglas 平臺、基因芯片平臺，協助高校、科研院所開展基礎理論研究，助力分子育種源頭創新。主要完成的工作包括，玉米、小麥、甜瓜、茄子等作物的抗病、抗逆等重要重要性狀的 QTL 定位，玉米小麥等作物的種質資源遺傳分析等。

協助遼寧省農科院開展的玉米大斑病抗病位點研究，論文發表在 Fontiers in Plant Science。該研究中首先采用高密度芯片對抗感池進行分析，找到可能的候選區間，然后對回交群體中的極端表型單株進行芯片分析，根據卡方測驗排除基因型與表型無相關性位點，最后通過Douglas 平臺對每一世代回交群體的個體進行 KASP 標記檢測，結合田間表型分析，逐步縮小定位區間。

協助上海農科院開展甜瓜抗病 QTL 鑒定研究，論文發表在 Fontiers in Plant Science。該研究中首先對抗感池及抗感雙親進行轉錄組測序，分析差異位點區間，在每一候選區間均勻分布選擇部分位點開發 KASP 標記，檢測 F2 群體的每個個體，結合表型分析，排除無相關性位點，鎖定候選區間。

本研究利用 SNP 芯片對不同改良世代的遼熱群體遺傳背景進行分析，闡述群體改良過程中基因組水平的遺傳改變，為遼熱群體的育種應用和下一部分子標記輔助選擇提供基礎。
2. 助力優良種質篩選，提升品種選育
通過前景篩選、背景選擇、轉基因選擇等方法，協助育種團隊進行優良種質選擇，改良了玉米抗莖腐病、絲黑穗病、抗蟲性及除草劑抗性等。

本中心分子育種團隊開展的玉米抗莖腐病種質資源改良，改良后的材料抗性得到提高。
3. 助力品種知識產權保護，尊重品種創新
研發中心旗下檢測公司獲得了中華人民共和國合格農作物種子質量檢驗機構合格證書，品種真實性檢測能力得到機構和業界認可，真實性檢測連續多年在農業部組織的農作物種子質量檢驗機構資格考核能力驗證中 0 誤檢率，評級為 A。構建了玉米部分品種、大豆省審品種及部分其他作物品種的 DNA 指紋數據庫。

協助某育種團隊對兩年送審樣品進行質控，發現第二年送審樣品為一個錯誤的雜交組合，通過進一步分析得知，該組合發生了父本間或父本與父本姊妹系間雜交，而導致該樣品為一個接近自交系的樣品。

協助某育種團隊鑒定雜交種種子的目標基因轉化率，并根據轉化率分析可能造成目標基因轉化率低的原因。

東亞種業旗下的遼寧東亞農作物種子檢驗檢測有限公司是獨立的第三方檢測機構，2019年通過了農業部的機構考核，并取得農業部CASL認證，具有向社會出具有法律效力的檢驗檢測數據及檢驗報告的資質。在農業農村部組織的機構考核能力驗證中，2020-2021連續兩年真實性檢測能力表現評價等級為A，誤檢率為0%。樣品數量成指數倍增長，數據質量和檢測時效得到業界認可。東亞種業愿以進一步全面開放的情懷，踔厲奮發、勇毅前行，助力農民豐收，為現代民族種業建設、中國現代農業發展和國家糧食安全做出更大的貢獻。